Это очень интересный вопрос. Языки аборигенов постепенно отмирают, но сейчас правительство вроде как прикладывает усилия и вкладывает средства в их сохранение. Например, в прошлом, кажется, году, был открыт телеканал для аборигенов, вещающий на разных языках. Есть здесь "аборигенные деревни", фальшивые, для туристов, но интересные, в них можно ознакомиться с культурой и традициями разных племён. Первыми, кто изучал культуру и языки тайваньских аборигенов, были японцы, в то время, когда Тайвань был колонией Японии (1895-1945). От них остались подробные антропологические описания разных племён. Наши соотечественники тоже делали посильный вклад. Например, первым, кто изучал язык племени Цоу, был Н.А.Невский, учёный-японист. Во время революции он находился в Японии, приезжал на Тайвань, составил словарь языка Цоу. Представители племени до сих пор ему за это благодарны. Затем Невский вернулся в СССР и в 37-м был расстрелян как японский шпион.
Б.Л. Рифтин приезжал на Тайвань в начале 90-х и составил описание быта племени Цоу, сравнив его с бытом начала века, описанным Невским.
Сейчас аборигены - из тех, что не ассимилировались - в основном работают...аборигенами, то есть развлекают туристов, устраивают для них представления, демонстрируют ремёсла, изготавливают традиционные изделия на продажу. Многие представители горных племён работают гидами в горах. К примеру, недавно лазили на гору Юйшань, нас вёл абориген из племени Бунун. Кажется, все гиды, что нам там встречались, были из аборигенов.
Традиции, культура и языки горных племён сохранились лучше, чем равнинных, в связи с их изолированностью от переселенцев с материка. К примеру, равнинное племя Кетагелан, населявшее север Тайваня (устье и долина реки Даньшуй), полностью растворилось - было ассимилировано ханьцами. Всё, что от него осталось - несколько географических названий в Тайбэе. Это в память о них Чэнь Шуй-бянь, будучи мэром Тайбэя, переименовал улицу Долголетия Чан Кай-ши в бульвар Кетагелан - это площадь перед Президенстким дворцом.
(Это очень ненаучное и популярное изложение по памяти! Ошибки и неточности возможны! Дополнения и поправки приветствуются!)