Если у ребенка нет проблем с визами, то ты пишешь стандартное (в консульстве есть) письмо погранвластям РФ - мол, ребенок едет в Россию и возвращается в Японию один (или с кем там).
Аэрофлот и не только оказывает такую услугу как сопровождение ребенка. Только билет ему придется за полную стоимость покупать. Тогда прямо от регистрации его принимает стюардесса и не отходит от него, пока не сдаст с рук на руки встречающим.