Якуб-бек был отравлен 30 мая 1877 г. Нияз-беком Хотанским, вопрос по моему давно закрыт. Это произошло в городке Курля, где Якуб-бек высиживал, бежав с поля боя в Турфане, и дожидаясь результатов переговоров, которые должны были начаться в Лондоне между представителем Йеттишара Саид Якуб Ханом и представителем Цинов Го Сун-Тао при посредничестве Англии. Они начались уже после его смерти, 13 июня 1877 г., но об этом в Лондоне еще не знали. МИД Англии 7 июня послал через Го Сун-Тао предложение о своем посредничестве в военном конфликте в Восточном Туркестане, выдвинув следующие условия как основу для урегулирования:
1) Признание эмиром Якуб-беком сюзеренитета Китая. Страна, которой он управляет, остается полностью под его контролем, но он обязуется периодически посылать представителей с подарками или данью в Пекин к великому императору Китая.
2) Определение границ между Кашгарским государством и Китаем.
3) Заключение между ними соглашения о взаимопомощи в случае необходимости.
Ранее в марте Якуб-бек встречался также в Курле с Николаем Пржевальским, который подтвердил, что Россия не будет вмешиваться в конфликт, пока Якуб-бек ограничивается в управление страной, лежащей к югу от Тянь-Шаня. Якуб-бек выразил же свое неудовольство, что Россия за добро платит злом и продолжает отказываться признавать Йеттишар, несмотря на выполнение Якуб-беком всех предыдущих условий России о его полном отказе от всех владений в Джунгарии. Об этом же он заявлял во время визита миссии Куропаткина ( впоследствии Командующий Русской Армии в Маньчжурии во время Русско-Японской войны 1904-05гг.)в конце 1876 г. в Курлю.
Цины начали наступление в Джунгарии в июле 1876 г. из Гучена и районов севернее Манаса. Сопротивление им оказали только дунгане во главе с Баяньху, а войска Якуб-бека получили приказ огня не открывать и в столкновение с Цинами не входить. В результате его действий уже 19 августа 1876 г. цинские войска без боя вошли в Урумчи. Войска Якуб-бека были отведены на Дабаньчен и Турпан, за Тянь-Шань, в точном соответствии с секретными договоренностями с русскими. Всего в Турпане, Токсуне и Дабаньчене было сконцентрировано до 40,000 войск Якуб-бека, однако когда весной 1877 Цины возобновили наступление, ударив с 2-х сторон, с севера на Дабаньчен и с востока на Чиктым и Пичан со стороны Кумула, опять был получен приказ Якуб-бека огня не открывать, при этом он сам сбежал в Курлю. В результате в течение всего одного месяца к концу апреля вся Турпанская котловина оказалась в руках Цинов. При этом " ворота в Кашгарию " были открыты, но дальнейшее продвижение Цинов было остановлено вследствии демарша Англии, предложившей свое посредничество в урегулировании конфликта.
В связи с вышесказанным не удивительно, что против Якуб-бека, вставшего на путь распродажи уйгурских земель во имя сохранения своей абсолютной власти, был составлен заговор уйгурских феодалов, в результате которого он был убит. Но спасти Йеттишар, в результате начавшейся междуусобицы, распада армии и массового перехода на сторону Цинов бывших чиновников, служивших им до восстания 1864 г., оказалось невозможным. В этих условиях Цины объявили Го Сун-Тао не уполномоченным на ведение переговоров и Цзо Цзун-Тан возобновил наступление в августе 1877. 7 октября был взят Карашар, 9 октября Курля, 19 октября Кучар, 21 октября Бай, 24 октября Аксу, 26 октября Уч-Турпан. Также стремительно пали города в Западной Кашгарии, 17 декабря был взят в Кашгар, 19 декабря Яркенд, 22 декабря Янгигисар, 31 декабря Хотан. При взятии этих городов в качестве трофеев Цины взяли 110 пушек, более 10,000 коней и большое количество винтовок. За оказанные " услуги " Нияз-бек был назначен хакимом Яркенда. Но не этого он ждал от Цинов. Оставшись недовольным и желая отомстить, он организовал тайную оружейную мастерскую в Яркенде, собирал вокруг себя недовольных, но был раскрыт Цинами и отправлен под арестом в Кашгар. Здесь он покончил с собой, приняв яд, который хранил в перстне. Ранее этим же ядом был отравлен Якуб-бек.
