Я спокойно в The Bat! (2.12 у меня) по-японски пишу так:
1) Создаю письмо
2) Выбираю кодировку Japanese (Shift-JIS)
(Options —> Message Encoding —> Japanese (Shift-JIS))
3) Ставлю формат письма HTML/Plain Text
(Options —> Message Format —>HTML/Plain Text)
И все, спокойно пишу по-японски (IME) и по-русски одновременно, если таковое требуется (ведь в этой кодировке есть русские буквы). Также можно вставлять текст в такое письмо из клипбоард (если напишешь письмо в Word или NJStar).