Недели 2 - это достаточно много. Есть два варианта: 1) приехать в одно (хорошее) место и там жить: лениться, загорать, купаться, есть рыбу, пока не надоест. (Если везет с погодой) 2) Поездить по разным местам. Ко второму варианту располагает Ваш, более чем достаточный, лимит времени, но у него есть и минус: устанете тем больше, чем больше ездите, и, все равно, - все вокруг одного и того же озера: что в фас, что в профиль.
Я думаю, совершенно беспроигрышный выбор - Ольхон. Можно там жить, минимум, неделю, объездить все (Хобой, Саган-Хушун, Хара-Нуур, Ухан, Ижимей), затем возможны варианты. Например, - на Аршан (правда, это уже не Байкал, а Тункинская долина (не путать с Чуйской
)А можно, если понравится, все две недели на Ольхоне лениться.
У местных жить - не вопрос, только имейте в виду, что для местных это - давно уже бизнес. Палатку иметь с собой желательно в любом случае для большей автономности.
Если вспомню чего - напишу в личку.