1. Тонкостей тут много, но в принципе основным получается так, что если тебя готов взять профессор данного вуза под свою опеку и рекомендации, все может получиться (помимо собеседований и экзаменов при пос-ве), так я понимаю?
Да, согласие профессора - это уже больше полдела. И к тому же оно получается уже после положительных итогов письменных экзаменов, так что это даже ещё больший процент.
2. Магистром в Японии можно стать и не по своей профильной спец-ти: с лингвистическим образованием можно подавать на экономический, затрагивая например проблемы Японии-Китая-России экономич.характера. Такое возможно?
Если вы сумеете обосновать необходимость такого выбора и убедить японцев, что действительно это вам нужно - то да. Однако связь с предыдущим обучением всегда спрашивается, будьте готовы ответить, почему вы не хотите учиться далее по своей специальности и не поступите ли вы потом так же с новой специальностью.
3. Сроки стажировки и уровень японского определяет сам университет и профессор, а грант выделяет посольство Японии или сам университет?
Срок определяете вы сами - в документах есть пункт о желательном для вас сроке. Далее в основном от вас и зависит, сколько именно лет вы будете учиться.
Впрочем, в некоторых университетах просто нет преподавателей по отдельным специальностям, которые могут вести докторантуру. После магистратуры тогда можно перевестить с другой университет, где преподаватель есть.
Уровень японского определяется в экзаменах - там ведь тест по японскому, на собеседовании, и по приезду в университет на университетском тесте. Сдавайте на Норёку Сикэн, это может быть доводом для того, чтобы не посещать тест по приезду в университет.
Гран выделяет МинОбразования Японии, а не посольство или университет. Поэтому последний этап отбора - отбор по документам, проходящий в Министерстве. Им должнен понравится ваш план исследования.