в pdf обычно идет разметка специальная, так как формат файла сам по себе what-you-see-is-what-you-get, т.е. там идет форматирование текста, который , в отличие от Ворда, должен на любом экране , либого устройтсва или при печати выглядеть всегда одинаково.
ворд же переформатирует всегда текст под размер листа , экрана, масштаба и т.п. поэтмоу всегда , когда переносишь из pdf в ворде, все ломается.
тут два выхода: либо распечатывать из pdf, либо в ручную потом в ворде заново делать форматирвоание текста.
еще в самом ворде есть функция: импортировать pdf, когда он сам открывает pdf и переформатирует автоматически, но.... как правило он это так же делает довольно криво, особенно, если там еще к тексту идут картинки и прочие графики.