Оформляя визу через турфирму, платишь им всю сумму, не заморачиваясь, есть там консульский сбор или нет. Если общая сумма устраивает, меня обычно мало интересует, что там кому и куда из нее пойдет. Главное, чтобы дело было сделано. Несколько лет назад оформляла визу в самостоятельно (в Москве), никаких сборов не было, все бесплатно. Но в последних поездках прибегала к услугам турфирм, как-то отдельно этот конс.сбор не выделялся, так что и нет его, наверно. Да даже если есть, мне не кажется, что это такой уж принципиальный расход по сравнению с другими тратами, связанными с поездкой, а речь здесь как раз шла о сумме в день уже в самой Японии.