Конференция в Дайрене, на которой японскую сторону представлял начальник политического отдела штаба экспедиционного корпуса японской армии во Владивостоке Мацусима, а ДВР - министр иностранных дел Юрин, а затем заместитель председателя правительства Петров, началась 26 августа 1921 года. Сначала проект соглашения предложила делегация ДВР. Проект конвенции ДВР из 29 статей, заявленный 6 сентября в ходе 7-го заседания конференции, включал в себя следующее. Во вступительной части говорилось, что конвенция заключается во имя мира, добрососедства и торговли между двумя странами на основе принципов равенства, справедливости и взаимовыгоды. 2-я статья предусматривала невмешательство во внутренние дела, 7-я - народы обеих стран взаимно признают свободу совести и политических убеждений, 12-я - свободу торговли и мореплавания, 20-я - пересмотр существующей рыболовной конвенции и участие в будущих переговорах советского правительства, 21-я - признание правительством ДВР политики открытых дверей, предоставление концессий японским предпринимателям, 22-я - вывод японских войск в течение месяца после заключения соглашения, 24-я -скорейшее установление дипломатических отношений между двумя странами. ДВР, стремившаяся в кратчайшие сроки добиться вывода японских войск, настаивало на принципе взаимности в ходе переговоров, намеревалась получить уступки от Японии за счет предложений о предоставлении концессий, стремилась получить согласие на участие советского правительства в переговорах, используя для этого проблему рыболовства.
6. В ходе конференции японская сторона по каждому пункту проекта ДВР настаивала на своем видении, а 26 сентября в ходе 12-го заседания предложила свой проект конвенции, состоявший из 17 статей. 1-я статья предусматривала отказ от прямой или косвенной пропаганды в отношении друг друга, которая бы носила враждебный или наносящий ущерб характер, запрещала деятельность любых объединений и организаций, которая могла бы подорвать порядок и стабильность как внутри страны, так и на территории страны-партнера, 2-я - ДВР поддерживает некоммунистическое государственное устройство, 5-я - признается взаимная торговая, производственная, рабочая деятельность на территории обеих стран, сохраняются хорошие равноправные условия для своего народа в области торговли и промышленности, 6-я - свобода торговли и мореплавания, 8-я - не создавать условий или органов, препятствующих международной торговле в торговом порту Владивосток, 11-я - правительство ДВР признает политику открытых дверей, отменяет ограничения на добычу ископаемых, лесную промышленность, торговлю для японских подданных, признает свободу свободного плавания по Амуру для японских судов, и не делает препятствий для судоходства по Сунгари при согласии стран, имеющих к этому отношение, 12-я - правительства ДВР и Японии уважают заключенные договоры, уважают существующие права обоих народов.
7. Это были секретные переговоры, но весьма интересен тот факт, что Общество изучения экономики Востока, членами которого были главы владивостокских представительств таких крупных японских компаний как Мицуи, Мицубиси-сёдзи, Судзуки-сётэн, Нитиро-дзицугё, Осака-сёсэн, представили министру иностранных дел Утида свои предложения - "Перечень пожеланий по вопросам японо-российской торговле", в котором предлагалось по случаю вывода японских войск получить долговременные права на недвижимость, превратить Дальний Восток в зону свободной торговли, обеспечить права на разработку полезных ископаемых, добычу леса и рыболовства. Утида в свою очередь попросил не предавать гласности этот Перечень, так как это могло повлиять на ход переговоров.
8. Конференция завершила свою работу 16 апреля 1922 года, она продолжалась почти 8 месяцев, в течение которых было проведено примерно 30 заседаний. За это время делегация ДВР два раза предлагался исправленный проект (3 декабря, 14 декабря) японского варианта конвенции, состоявшего из 17 статей, а японская сторона предлагала вновь исправленные варианты 6 и 8 апреля 1922 года.
Первоначально делегация ДВР требовала исключить из текста конвенции ст.2 (о некоммунистическом строе), ст.8 (о демонтаже крепостных сооружений Владивостока), ст.12 (об уважении договоров царского и японского правительства, уважения прежних прав граждан обеих государств, тем самым количество исправлений и дополнений росло. Тем самым в ст.2 уже стало говорится о республиканском строе, а термин "некоммунизм" был признан неясным по своему значению, новая трактовка ст.8 гласила, что правительство ДВР не будет строить новых укреплений и восстанавливать старые, а способы реализации и поддержания мер по обороне являются прерогативой государства, новая редакция ст.12 предполагала в частности, непризнание прав на добычу леса, предоставленные японцам правительством Меркулова.