Ну так значит все в порядке. Зачем кукарекать (после жуткого перелета, тем более), если есть двухкратная виза?!
По гостиницам: здесь зависит во сколько конкретно Вы вылетаете из Шэньчжэня. В Монгкоке можно заночевать незадорого, но все равно это будет относительный гадюшник, не стоящий лишь нескольких часов времяпровождения. Я бы, пожалуй, рванул как можно скорее на территорию mainland'a, а там бы уже осмотрелся. Хотя не факт, что в Хуангане найдутся недорогие гостиницы (я там никогда не был).
Да, рядом с Airport Express Kowloon station никаких гостиниц нету. Там вообще почти ничего нету. Так что оттуда надо будет на такси добираться куда-нить в Монгкок. В Монгкоке есть станция KCR, и именно оттуда можно уехать на электричке в Шэньчжэнь через Lowu утром,
если время позволяет(!). Аэропорт от границы в Lowu очень далеко. Если время позволяет, утром, после пересечения границы, лучше всего сесть на метро в западном направлении, доехать до самой последней станции, и потом на такси до аэропорта. Но все это - часы и часы в пути.
Если время позволяет, можете заказать вот тут:
http://www.dragonhostel.com/ - дешево и сердито. И визитка есть на сайте - таксисту показать.
Можно, конечно, и в lounge, как писал Sergey в верхней части топика. Но только не выходя в Гонконг и не используя ГК визу (по другому нельзя). Но тогда, пожалуй, стоит справиться у служащих аэропорта, где будет в эту ночь до посадки утром на ferry находиться Ваш багаж. Впрочем, проверьте на сайте ГК аэропорта расписание ferry, я не уверен, что поутру на самом первом ferry из аэропорта Вы на самолет из Шэньчжэньского аэропорта успеете.
А Гонконг и его границу воспринимайте как отдельное государство... слегка отличное...
от других. Тогда все будет проще.