Да, вы имеете полное право приобретать такой билет.
Отказываются его оформлять те агенты, которые не могут и не хотят разбираться в категориях виз и т.п. то есть, виза для них, как афиша для козы - они ровным счетом ничего в ней не понимают.
На регистрации билетов, как правило, работают более опытные сотрудники, перевидавшие кучу разных виз и паспортов. И если где-нибудь во Владивостоке сотрудница может быть засомневается и побежит перепроверять, то в Шереметьево такая вероятность всегда ниже. Однако, поскольку из любого правила есть исключения, то следует быть готовой спокоино и грамотно разьяснить свою ситуацию...
Интересная дискуссия на эту тему была в "китайском" разделе здесь:
http://polusharie.com/index.php/topic,2963.msg102239.html#msg102239 (начиная с поста номер 20)
А где выдана Ваша виза? И на какой она срок? (Если все же 90 дней, сотрудники а/к могут упереться рогами, если более - ваша правда 100%!
)
Совет: Пользуитесь услугами (по возможности) не Аэрофлота, а более респектабельной компании: они, как правило, компетентнее и "щедрее" в таких вопросах.